苯甲醇是一種重要的中間體,能用于化學、制藥和聚合物工業(yè)中許多不同化合物的商業(yè)制備。目前苯甲醇的工業(yè)生產(chǎn)主要利用甲苯作為原料,通過化學法生成,該過程繁瑣且會生成大量副產(chǎn)物而污染環(huán)境。因此,如何發(fā)展苯甲醇的綠色高效生產(chǎn)方法一直受到工業(yè)界和學術界共同關注。
近日,湖北大學生命科學院、省部共建生物催化與酶工程國家重點實驗室李愛濤教授、陳純琪教授和郭瑞庭教授團隊共同合作,成功解決了這一難題。他們首次解析了一種特殊的“萬能酶”P450tol及其復合體晶體結構,并基于此構建了一種活性和穩(wěn)定性均明顯提升的人工融合酶,實現(xiàn)了苯甲醇的高效綠色生物合成,相關研究成果發(fā)表于國際期刊《催化作用》。
迄今唯一可天然催化甲苯生成苯甲醇的酶
酶,這種地球生命中最強大的化學工具,通過理性設計和定向進化手段,展現(xiàn)出了在生物催化領域的強大功能。其中,細胞色素P450酶能夠識別多種底物(參與生化反應的物質(zhì)),因此也被稱為“萬能酶”。而利用基因工程改造P450酶來量身定制化學反應過程和生產(chǎn)工藝,成為一個熱門研究方向。
李愛濤從甲苯降解菌中鑒定了一種特殊的P450酶,并將其命名為P450tol。它能以甲苯為底物,生成專一的產(chǎn)物苯甲醇,成為迄今發(fā)現(xiàn)的唯一可以天然催化甲苯生成苯甲醇的酶。
目前苯甲醇通用的工業(yè)生產(chǎn)采取兩步法,以甲苯為原料,需要用到劇毒的氯氣和強堿氫氧化鈉,并產(chǎn)生有毒副產(chǎn)物。“之所以會這樣,是因為傳統(tǒng)化學合成過程中,繞不開C-H鍵官能團化。”李愛濤解釋,由于C-H鍵具有較高的解離能,通常具有較高的熱力學穩(wěn)定性和較低的化學反應性,因此,C-H鍵官能團化是傳統(tǒng)化學合成中一個極大的難題。
因此,李愛濤發(fā)現(xiàn)的P450tol讓人們看到了生物合成苯甲醇的希望。然而P450tol三維結構信息的缺乏,限制了P450tol的相關基礎研究與未來應用。
配體結合方式使反應更精準高效
要改造高效的P450tol,必須揭開酶結構的面紗。由于2020年郭瑞庭團隊首次解析了一種自給自足P450酶的全長晶體結構,李愛濤選擇與郭瑞庭團隊合作,順利解析出P450tol的空結構以及與底物甲苯及產(chǎn)物苯甲醇的復合體結構。這些結構信息表明,P450tol能幫助甲苯通過一步反應生成苯甲醇,且反應沒有副產(chǎn)物。
陳純琪介紹,P450酶的活性區(qū)都會帶一個血紅素分子參與催化反應,我們解析的P450tol也不例外,底物甲苯位于由一系列疏水的氨基酸組成的口袋中,甲苯的甲基朝向血紅素中心的鐵離子,兩個氨基酸(F329和A279)分別位于底物的兩側,牢牢鉗住了甲苯的苯環(huán),甲苯前方還有一個氨基酸(V326)負責固定整個甲苯的位置,這樣催化反應就可以精確的發(fā)生在芐基位,而不是其他位置,如此精巧地反應也只有這種“萬能酶”可以做到了。
“此外,我們也觀察到了一個非常有意思的現(xiàn)象,甲苯或苯甲醇并不能將P450tol的活性區(qū)完全占據(jù),還有一些多余的空間,所以我們猜測P450tol或許可以結合比甲苯或苯甲醇更大一些的底物。”陳純琪表示,復合體結果與團隊推測的一致,P450tol也可以與一些鹵代甲苯形成復合體,且可以精確地在芐基位發(fā)生羥基化反應。所有這些結果都顯示,配體會以有利于反應發(fā)生的方式結合并參與反應,這也使酶的反應更精準而高效。
人工融合酶有望用于工業(yè)生產(chǎn)
自然界中大部分的P450酶都需要一個能夠與之匹配的還原酶來提供電子以發(fā)生催化反應,這對于后續(xù)的應用也是一個難題。為了實現(xiàn)工業(yè)應用,尋找天然的自給自足型P450酶或者索性構建高效的自給自足型P450人工融合酶成為科研工作者關注的焦點。
“我們將P450tol和CYP116B46的還原酶結構域融合,構建出自給自足型人工融合酶,其活性、穩(wěn)定性和半衰期都獲得了很大的提升。”李愛濤說。
不僅如此,P450tol-CYP116B46還可以催化丙基苯在近末端或芐基位區(qū)域選擇和立體選擇羥基化,這些羥基化產(chǎn)物中,有些是非常重要的藥物中間體,如安非他命、司立吉林和組蛋白酶K抑制劑的組成成分。目前,P450tol和CYP116B46的融合是世界上首例報道的穩(wěn)定性和活性均大幅提升的人工融合酶,未來有望應用于工業(yè)生產(chǎn)中。
基于P450tol的三維結構,郭瑞庭團隊使用蛋白質(zhì)工程的手段理性設計和改造,使其反應能夠更多地朝向?qū)θ祟愑幸娴姆较虬l(fā)生。
“未來,隨著結構生物學、人工智能、酶定向進化等發(fā)展,通過理性設計和改造,獲得更多新的具有重要功能的酶來造福于人類,將會是一個重要的研發(fā)方向,我們也將繼續(xù)致力于更多P450tol人工融合酶的構建。”郭瑞庭說。(陳曦)
關鍵詞: 安非他命 司立吉林 組蛋白酶K抑制劑 羥基化產(chǎn)物 湖北大學